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饲养者若是想要分辨出草龟的性别，可以查看它们的腹甲部位来判断。母草龟的腹甲部位呈现平面状，花纹较为密集且背甲片窄，而公龟的腹甲会向内凹进去，花纹也较为稀疏。
除了看草龟的腹甲部位，饲养者还可以查看草龟的尾巴来判断。公龟的尾巴较为粗短，且距离肛门比较远，母草龟的尾巴细长，距离肛门的距离较进。
若是查看草龟的腹部和尾巴仍然无法判断它的性别，饲养者也可以挤压它的屁股将生殖器露出来后查看。不过这种方法会使乌龟感到难受和痛苦，是不建议使用的。
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