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头部区别:许多养殖者会将黄耳龟和黄头侧颈龟混淆,它们的确有一定的相似性,不论是花纹还是背部都是比较类似的。不过,它们也有一定的区别。二者头部花纹的区别是它们最明显的区别。黄耳龟的头部花纹是流线型的,一般只有两条,分布在头部的两边,可能是对称的,看起来就像是它的两只耳朵,因此叫做“黄耳龟”。但是黄头侧颈龟的头部花纹则是非常不一样的,它们头部的花纹是呈块状的,而且不只两个,它们分散在黄头侧颈龟的头部,而且呈不规则排列的状态。
颈部区别:黄耳龟和黄头侧颈龟的颈部也是有区别的。黄头侧颈龟的颈部特点非常明显,它们在将颈部缩到龟壳中的时候,是侧着缩进去的,这也是它们得名的原因,但黄耳龟就不是这样。另外,黄头侧颈龟一般无法将颈部完全缩进龟壳中。